17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1595 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1595  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  158  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1563  hypothetical protein  48.65 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0276  hypothetical protein  48 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0659  hypothetical protein  48.68 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.473664  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3400  hypothetical protein  46.05 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  44.74 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4012  hypothetical protein  42.11 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  44.74 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  44.74 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0629  hypothetical protein  44.74 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.375966  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0586  hypothetical protein  44.74 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0629  hypothetical protein  44.74 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156939  normal  0.671447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2941  hypothetical protein  35.62 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170157 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  35.06 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3116  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1159  hypothetical protein  35.53 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0834  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>