20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1563 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1563  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  154  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0276  hypothetical protein  60.81 
 
 		 76 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  50.67 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  50.67 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  50.67 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0659  hypothetical protein  51.35 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.473664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0586  hypothetical protein  50.67 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1595  hypothetical protein  48.65 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4012  hypothetical protein  47.95 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3400  hypothetical protein  46.58 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0629  hypothetical protein  45.21 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.375966  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0629  hypothetical protein  45.21 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156939  normal  0.671447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  36.36 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1159  hypothetical protein  35.44 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0822  hypothetical protein  35.14 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0065  hypothetical protein  29.11 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2941  hypothetical protein  34.78 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0213  hypothetical protein  35.9 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000057  hypothetical protein  30.86 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0873504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>