26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4193 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4868  hypothetical protein  56 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0054  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.541214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0070  hypothetical protein  46.05 
 
 
82 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3980  hypothetical protein  41.33 
 
 
74 aa  60.1  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4281  hypothetical protein  44.74 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0068  hypothetical protein  44.74 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0068  hypothetical protein  43.42 
 
 
81 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0073  hypothetical protein  42.11 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0073  hypothetical protein  39.24 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000535971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0069  hypothetical protein  39.76 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0071  hypothetical protein  39.76 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1595  hypothetical protein  35.06 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1563  hypothetical protein  36.36 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0065  hypothetical protein  30.59 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1159  hypothetical protein  35.06 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3783  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0912  hypothetical protein  36.99 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454978 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000057  hypothetical protein  39.74 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0873504  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05680  hypothetical protein  48.84 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  32.97 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0961  hypothetical protein  39.29 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  32.97 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  32.97 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  32.97 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  32.97 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>