11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3116 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01392  hypothetical protein  50.67 
 
 		 75 aa  66.6  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1595  hypothetical protein  34.72 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4868  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1159  hypothetical protein  32.91 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000057  hypothetical protein  31.58 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0873504  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05680  hypothetical protein  33.78 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2940  hypothetical protein  44.74 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  34.67 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  34.67 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  34.67 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>