18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01392 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01392  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  141  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3116  hypothetical protein  50.67 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05680  hypothetical protein  36.49 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000057  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0873504  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  38.81 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  38.81 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  38.81 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0586  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0659  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.473664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0912  hypothetical protein  43.08 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4012  hypothetical protein  34.38 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  38.57 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3783  hypothetical protein  41.18 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0961  hypothetical protein  46.81 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1563  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0276  hypothetical protein  35.94 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1159  hypothetical protein  37.68 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>