15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4012 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4012  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  184  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0629  hypothetical protein  78.95 
 
 		 76 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156939  normal  0.671447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3400  hypothetical protein  77.63 
 
 		 76 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0629  hypothetical protein  77.63 
 
 		 76 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.375966  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  75 
 
 		 76 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  75 
 
 		 76 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  75 
 
 		 76 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0586  hypothetical protein  75 
 
 		 76 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0659  hypothetical protein  69.74 
 
 		 76 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.473664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0276  hypothetical protein  64 
 
 		 76 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1563  hypothetical protein  47.95 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1595  hypothetical protein  42.11 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0822  hypothetical protein  37.31 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0065  hypothetical protein  52.63 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0912  hypothetical protein  31.88 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>