21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0065 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0065  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3980  hypothetical protein  43.18 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0070  hypothetical protein  39.77 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4281  hypothetical protein  39.77 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0073  hypothetical protein  43.96 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0068  hypothetical protein  39.77 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0054  hypothetical protein  39.56 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.541214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0068  hypothetical protein  37.5 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3783  hypothetical protein  41.18 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0071  hypothetical protein  40.79 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0073  hypothetical protein  36.84 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000535971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3578  hypothetical protein  36.59 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  30.59 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0069  hypothetical protein  39.47 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4012  hypothetical protein  52.63 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  52.63 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0586  hypothetical protein  52.63 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  52.63 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1563  hypothetical protein  29.11 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  52.63 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4868  hypothetical protein  31.11 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>