14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3400 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3400  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0629  hypothetical protein  98.68 
 
 		 76 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156939  normal  0.671447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0629  hypothetical protein  97.37 
 
 		 76 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.375966  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4012  hypothetical protein  77.63 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  69.74 
 
 		 76 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  69.74 
 
 		 76 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  69.74 
 
 		 76 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0586  hypothetical protein  69.74 
 
 		 76 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0659  hypothetical protein  67.11 
 
 		 76 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.473664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0276  hypothetical protein  65.33 
 
 		 76 aa  97.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1563  hypothetical protein  46.58 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1595  hypothetical protein  46.05 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0822  hypothetical protein  39.74 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3980  hypothetical protein  37.66 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>