18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0276 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0276  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  66.67 
 
 
76 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  66.67 
 
 
76 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  66.67 
 
 
76 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0586  hypothetical protein  66.67 
 
 
76 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0659  hypothetical protein  68 
 
 
76 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.473664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1563  hypothetical protein  60.81 
 
 
76 aa  100  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4012  hypothetical protein  64 
 
 
92 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0629  hypothetical protein  65.33 
 
 
76 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.375966  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3400  hypothetical protein  65.33 
 
 
76 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0629  hypothetical protein  64 
 
 
76 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156939  normal  0.671447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1595  hypothetical protein  48 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0822  hypothetical protein  38.67 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05680  hypothetical protein  40 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000057  hypothetical protein  38.96 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0873504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2941  hypothetical protein  35.71 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0170157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1159  hypothetical protein  38.89 
 
 
93 aa  42  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1699  hypothetical protein  44.19 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>