17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0822 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0822  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0912  hypothetical protein  58.57 
 
 
70 aa  83.6  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0961  hypothetical protein  61.43 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0834  hypothetical protein  55.71 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0276  hypothetical protein  38.67 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4012  hypothetical protein  37.31 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0659  hypothetical protein  40.3 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.473664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0629  hypothetical protein  39.74 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156939  normal  0.671447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0629  hypothetical protein  38.96 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.375966  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3400  hypothetical protein  39.74 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  40.62 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  40.62 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  40.62 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0586  hypothetical protein  41.27 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4868  hypothetical protein  42.86 
 
 
78 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1563  hypothetical protein  35.14 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3578  hypothetical protein  32.86 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>