17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0834 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0834  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0912  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0822  hypothetical protein  55.71 
 
 		 70 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0961  hypothetical protein  64.29 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4012  hypothetical protein  35.94 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0276  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1595  hypothetical protein  35.82 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3578  hypothetical protein  42.65 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0629  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156939  normal  0.671447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2940  hypothetical protein  46.67 
 
 		 105 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3400  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  36.84 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0659  hypothetical protein  31.34 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.473664  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.375966  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3739  hypothetical protein  32.81 
 
 		 76 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3865  hypothetical protein  32.81 
 
 		 76 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3682  hypothetical protein  32.81 
 
 		 76 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>