25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3217 on replicon NC_008036
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008036  Sala_3217  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  65.48 
 
 		 403 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  44.78 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  44.62 
 
 		 400 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  41.79 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  37.5 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  35.44 
 
 		 415 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  39.8 
 
 		 411 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  37.14 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  37.93 
 
 		 412 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  37.14 
 
 		 411 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  36.73 
 
 		 397 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  30.93 
 
 		 411 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  41.89 
 
 		 397 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  36.76 
 
 		 279 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  32.43 
 
 		 438 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  31.08 
 
 		 407 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  36.23 
 
 		 417 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  32.61 
 
 		 436 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  31.34 
 
 		 410 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  29.33 
 
 		 403 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  31.15 
 
 		 398 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  30.77 
 
 		 419 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 459 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>