23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0820 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0820    100 
 
 		 572 bp  1134    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0754494  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  86.3 
 
 		 1374 bp  476  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  86.3 
 
 		 1374 bp  476  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  86.3 
 
 		 1374 bp  476  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  86.3 
 
 		 1374 bp  476  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  86.26 
 
 		 1383 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  86.26 
 
 		 1383 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  86.26 
 
 		 1383 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  86.26 
 
 		 1383 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  86.26 
 
 		 1383 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  86.26 
 
 		 1383 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  86.26 
 
 		 1383 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8305    87.16 
 
 		 1350 bp  105  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8413    87.16 
 
 		 1353 bp  105  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  84.4 
 
 		 1377 bp  105  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6370    83.22 
 
 		 1374 bp  97.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8430    93.1 
 
 		 1348 bp  83.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8297    86.36 
 
 		 156 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0126117  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  82.09 
 
 		 1383 bp  75.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  80.6 
 
 		 1377 bp  60  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  80.6 
 
 		 1377 bp  60  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5323    89.13 
 
 		 351 bp  52  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.736716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 939 bp  48.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>