24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8297 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8413    100 
 
 		 1353 bp  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8305    100 
 
 		 1350 bp  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8297    100 
 
 		 156 bp  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0126117  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8430    90.79 
 
 		 1348 bp  190  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  88.82 
 
 		 1383 bp  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  88.82 
 
 		 1383 bp  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  88.82 
 
 		 1383 bp  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  88.82 
 
 		 1383 bp  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  88.82 
 
 		 1383 bp  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  88.82 
 
 		 1383 bp  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  88.82 
 
 		 1383 bp  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  88.52 
 
 		 1377 bp  131  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6370    85.95 
 
 		 1374 bp  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0820    86.36 
 
 		 572 bp  79.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0754494  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  83.5 
 
 		 1374 bp  69.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  83.5 
 
 		 1374 bp  69.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  83.5 
 
 		 1374 bp  69.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  83.5 
 
 		 1374 bp  69.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  90.48 
 
 		 1383 bp  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  81.52 
 
 		 1377 bp  48.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  81.52 
 
 		 1377 bp  48.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 		 1353 bp  48.1  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 		 1353 bp  48.1  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 		 1353 bp  48.1  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>