18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5323 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5323    100 
 
 
351 bp  696    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.736716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  90.38 
 
 
1377 bp  63.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  100 
 
 
1374 bp  61.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  100 
 
 
1374 bp  61.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  100 
 
 
1374 bp  61.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  100 
 
 
1374 bp  61.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  84.15 
 
 
1383 bp  60  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  84.15 
 
 
1383 bp  60  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  84.15 
 
 
1383 bp  60  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  84.15 
 
 
1383 bp  60  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  84.15 
 
 
1383 bp  60  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  84.15 
 
 
1383 bp  60  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  84.15 
 
 
1383 bp  60  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3215  hypothetical protein  94.29 
 
 
441 bp  54  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0820    89.13 
 
 
572 bp  52  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0754494  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8430    93.55 
 
 
1348 bp  46.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6370    93.55 
 
 
1374 bp  46.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  93.55 
 
 
873 bp  46.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>