98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0160 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0160  peptidoglycan hydrolase  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00070985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.92 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.904588  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0470  aminodeoxychorismate lyase  38.16 
 
 
433 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.643443  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0564  N-acetylmuramidase  31.44 
 
 
212 aa  107  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000047381  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1247  muramidase (flagellum-specific)  39.74 
 
 
291 aa  105  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0424705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1448  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.8 
 
 
208 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1812  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.61 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0555239  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1517  N-acetylmuramidase  30.58 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284159  normal  0.409948 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0416  N-acetylmuramidase  32.03 
 
 
218 aa  89.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.72 
 
 
568 aa  75.9  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  30.87 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3400  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  24.68 
 
 
157 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.3 
 
 
574 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.49 
 
 
328 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1329  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.12 
 
 
389 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0311212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2589  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.12 
 
 
385 aa  61.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.15 
 
 
294 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1289  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.93 
 
 
348 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0429221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1912  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.24 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3241  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.43 
 
 
384 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.11 
 
 
269 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1267  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.43 
 
 
384 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1337  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.43 
 
 
384 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.75524  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.45 
 
 
303 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2235  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  24.88 
 
 
202 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1424  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.33 
 
 
380 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.33 
 
 
380 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2939  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.33 
 
 
380 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1348  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.29 
 
 
363 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.67 
 
 
474 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1169  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.03 
 
 
377 aa  54.7  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0546909  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.32 
 
 
655 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2954  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.67 
 
 
380 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  25 
 
 
318 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1311  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.32 
 
 
367 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2310  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.67 
 
 
372 aa  51.6  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.11 
 
 
352 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2417  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25 
 
 
314 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2316  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25 
 
 
314 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25 
 
 
314 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1734  N-acetylmuramidase  25.81 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  26.03 
 
 
316 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1913  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.94 
 
 
298 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1353  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  21.43 
 
 
341 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.58 
 
 
371 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2962  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.68 
 
 
318 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2330  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.14 
 
 
332 aa  48.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0533  peptidoglycan hydrolase  28.72 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.679599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3472  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.21 
 
 
414 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.603408  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00645  hemagglutinin  26.8 
 
 
283 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.92 
 
 
313 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1605  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.29 
 
 
336 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202328  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  27.27 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.27 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  27.27 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.27 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.81 
 
 
311 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.27 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.27 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3079  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.29 
 
 
337 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.73 
 
 
327 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.27 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.79 
 
 
619 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.79 
 
 
619 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  22.82 
 
 
353 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  23.97 
 
 
290 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  22.97 
 
 
327 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24080  flagellar rod assembly protein/muramidase  24.67 
 
 
325 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1782  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  29.38 
 
 
300 aa  45.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.03 
 
 
317 aa  45.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3722  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  24.84 
 
 
308 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0159  muramidase  22.56 
 
 
623 aa  44.7  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000101844  unclonable  2.74193e-27 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1225  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.87 
 
 
323 aa  44.7  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.633335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.38 
 
 
394 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1876  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.83 
 
 
320 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803787  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27980  muramidase (flagellum-specific)  24.38 
 
 
645 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.38 
 
 
384 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0148  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.89 
 
 
332 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2771  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  24.36 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133297  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2590  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.14 
 
 
320 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1250  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.54 
 
 
316 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.379236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1218  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  23.86 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000241377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4429  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.32 
 
 
300 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  24.5 
 
 
361 aa  42.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.89 
 
 
332 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.68 
 
 
328 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.84 
 
 
400 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2370  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  22.93 
 
 
325 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  22.29 
 
 
384 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1898  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.95 
 
 
399 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_002950  PG0076  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.14 
 
 
313 aa  42  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1943  peptidoglycan hydrolase FlgJ  24.14 
 
 
416 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0130803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2190  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.92 
 
 
316 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.84 
 
 
400 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06162  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.03 
 
 
392 aa  41.2  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01004  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.03 
 
 
392 aa  41.2  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135593  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1294  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.92 
 
 
316 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  hitchhiker  0.00280801 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.92 
 
 
316 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00375392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>