23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3877 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3980  putative phage endolysin  100 
 
 		 118 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.526858 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3920  putative phage endolysin  100 
 
 		 118 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3877  putative phage endolysin  100 
 
 		 118 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3799  putative phage endolysin  99.15 
 
 		 118 aa  244  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3812  putative phage endolysin  98.31 
 
 		 118 aa  243  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  36.27 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  36.27 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  32.74 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  32.43 
 
 		 220 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  33.01 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  30.63 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  32.67 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  31.9 
 
 		 583 aa  50.4  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  27.78 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 417 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  29.76 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  38.33 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  28.87 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>