45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1933 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1933  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3482  hypothetical protein  39.89 
 
 
180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3756  hypothetical protein  39.89 
 
 
180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3710  hypothetical protein  39.34 
 
 
180 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70202e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3379  hypothetical protein  38.25 
 
 
180 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3398  hypothetical protein  38.8 
 
 
180 aa  141  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0770  hypothetical protein  39.67 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000865264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2346  hypothetical protein  36.07 
 
 
181 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3729  hypothetical protein  38.25 
 
 
180 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3447  hypothetical protein  38.25 
 
 
180 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0957  hypothetical protein  39.67 
 
 
186 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0842  hypothetical protein  45.65 
 
 
186 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3752  hypothetical protein  37.16 
 
 
180 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0771  hypothetical protein  40.22 
 
 
186 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0955  hypothetical protein  39.67 
 
 
186 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3801  hypothetical protein  37.91 
 
 
180 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1514  hypothetical protein  37.36 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0981801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1045  hypothetical protein  38.04 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0102552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0769  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0865  hypothetical protein  39.67 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.075678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0822  hypothetical protein  39.67 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4411  hypothetical protein  39.67 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0835878 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0762  hypothetical protein  35.6 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.188363  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0919  hypothetical protein  40.76 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0176722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3468  hypothetical protein  33.51 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0314213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3487  hypothetical protein  33.51 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0242136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1471  hypothetical protein  34.59 
 
 
185 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000226091  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1984  hypothetical protein  31.22 
 
 
185 aa  99  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2017  hypothetical protein  31.22 
 
 
185 aa  99  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0203  protein of unknown function DUF1700  30.11 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.772778  normal  0.269904 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0345  hypothetical protein  32.2 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4508  hypothetical protein  27.62 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4305  hypothetical protein  33.77 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0056  hypothetical protein  23.81 
 
 
392 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0854  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  0.425397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  35.44 
 
 
456 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0594  hypothetical protein  26.96 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2721  hypothetical protein  21.6 
 
 
378 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0063  hypothetical protein  21.6 
 
 
395 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0064  hypothetical protein  21.6 
 
 
395 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1831  hypothetical protein  21.6 
 
 
378 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3296  hypothetical protein  21.6 
 
 
378 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.813618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0280  hypothetical protein  21.6 
 
 
395 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2657  hypothetical protein  21.6 
 
 
378 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3564  membrane protein  26.42 
 
 
199 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>