40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1471 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1471  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  363  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000226091  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2017  hypothetical protein  58.38 
 
 
185 aa  210  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1984  hypothetical protein  58.38 
 
 
185 aa  210  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1933  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3468  hypothetical protein  32.07 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0314213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3487  hypothetical protein  32.07 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0242136  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0762  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.188363  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3752  hypothetical protein  31.49 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3729  hypothetical protein  31.49 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3379  hypothetical protein  29.83 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1514  hypothetical protein  30.39 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0981801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3801  hypothetical protein  29.83 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3710  hypothetical protein  30.39 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70202e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2346  hypothetical protein  29.28 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3447  hypothetical protein  30.39 
 
 
180 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3398  hypothetical protein  30.39 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3756  hypothetical protein  30.39 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3482  hypothetical protein  30.39 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0842  hypothetical protein  30.81 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0957  hypothetical protein  28.72 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0955  hypothetical protein  29.51 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1045  hypothetical protein  30.05 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0102552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0770  hypothetical protein  29.74 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000865264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0203  protein of unknown function DUF1700  31.36 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.772778  normal  0.269904 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0771  hypothetical protein  29.23 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4411  hypothetical protein  38.04 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0835878 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0919  hypothetical protein  38.04 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0176722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0769  hypothetical protein  34.02 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0822  hypothetical protein  33.7 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0865  hypothetical protein  33.7 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.075678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0345  hypothetical protein  25.23 
 
 
417 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0056  hypothetical protein  23.53 
 
 
392 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1860  hypothetical protein  27.07 
 
 
176 aa  45.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0694107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2657  hypothetical protein  24.39 
 
 
378 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2721  hypothetical protein  24.39 
 
 
378 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0063  hypothetical protein  24.39 
 
 
395 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0064  hypothetical protein  24.39 
 
 
395 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1831  hypothetical protein  24.39 
 
 
378 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3296  hypothetical protein  24.39 
 
 
378 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.813618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0280  hypothetical protein  24.39 
 
 
395 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>