27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1860 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1860  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  346  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0694107  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0319  membrane protein-like protein  31.28 
 
 
203 aa  85.1  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2025  hypothetical protein  29.19 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000491087  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1437  membrane protein-like protein  32.61 
 
 
291 aa  63.2  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3468  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0314213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3487  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0242136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1271  hypothetical protein  42.86 
 
 
301 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000045052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3447  hypothetical protein  29.87 
 
 
180 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3398  hypothetical protein  32.03 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3482  hypothetical protein  32.03 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3756  hypothetical protein  32.03 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3710  hypothetical protein  32.03 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70202e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2346  hypothetical protein  28.48 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3752  hypothetical protein  29.09 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3729  hypothetical protein  31.17 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0762  hypothetical protein  30.11 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.188363  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0769  hypothetical protein  30 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0955  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157923  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1471  hypothetical protein  27.07 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000226091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0957  hypothetical protein  27.78 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0771  hypothetical protein  28.77 
 
 
186 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4411  hypothetical protein  27.78 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0835878 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0865  hypothetical protein  27.78 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.075678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0822  hypothetical protein  27.78 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0919  hypothetical protein  27.78 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0176722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1045  hypothetical protein  27.78 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0102552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0770  hypothetical protein  27.78 
 
 
186 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000865264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>