44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0854 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0854  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  360  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  0.425397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4305  hypothetical protein  50.26 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0203  protein of unknown function DUF1700  44.02 
 
 
188 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.772778  normal  0.269904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4508  hypothetical protein  43.78 
 
 
188 aa  121  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0056  hypothetical protein  44.35 
 
 
392 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0063  hypothetical protein  50.65 
 
 
395 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0064  hypothetical protein  50.65 
 
 
395 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1831  hypothetical protein  50.65 
 
 
378 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3296  hypothetical protein  50.65 
 
 
378 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.813618  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2721  hypothetical protein  50.65 
 
 
378 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0280  hypothetical protein  50.65 
 
 
395 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2657  hypothetical protein  50.65 
 
 
378 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0771  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0957  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0769  hypothetical protein  24.74 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0865  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.075678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0770  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000865264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0822  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1045  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0102552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0955  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157923  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1933  hypothetical protein  25.98 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0762  hypothetical protein  32.17 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.188363  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0842  hypothetical protein  23.71 
 
 
186 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4411  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0835878 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3398  hypothetical protein  27.94 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3756  hypothetical protein  27.21 
 
 
180 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0919  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0176722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3482  hypothetical protein  27.21 
 
 
180 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3710  hypothetical protein  27.21 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70202e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3752  hypothetical protein  27.94 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3447  hypothetical protein  27.21 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3801  hypothetical protein  27.21 
 
 
180 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1514  hypothetical protein  27.21 
 
 
180 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0981801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3729  hypothetical protein  27.21 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3487  hypothetical protein  29.9 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0242136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3468  hypothetical protein  29.9 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0314213  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0345  hypothetical protein  31.3 
 
 
417 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3379  hypothetical protein  26.92 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2017  hypothetical protein  30.61 
 
 
185 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1984  hypothetical protein  30.61 
 
 
185 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1860  hypothetical protein  26.67 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0694107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2346  hypothetical protein  24.29 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1069  hypothetical protein  30.25 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.239434  hitchhiker  0.0000020245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  25.2 
 
 
456 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>