44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4305 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4305  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0854  hypothetical protein  50.26 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  0.425397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0203  protein of unknown function DUF1700  42.62 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.772778  normal  0.269904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4508  hypothetical protein  52.07 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0056  hypothetical protein  40 
 
 		 392 aa  84.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0063  hypothetical protein  40.7 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0280  hypothetical protein  40.7 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0064  hypothetical protein  40.7 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2721  hypothetical protein  40.7 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2657  hypothetical protein  40.7 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1831  hypothetical protein  40.7 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3296  hypothetical protein  40.7 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.813618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3487  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0242136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3468  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0314213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0769  hypothetical protein  31.96 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0957  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0770  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000865264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0955  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4411  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0835878 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0771  hypothetical protein  34.83 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0842  hypothetical protein  30.93 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1045  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0102552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0762  hypothetical protein  36.89 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.188363  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0919  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0176722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0865  hypothetical protein  31.52 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.075678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1514  hypothetical protein  36.28 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0981801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3801  hypothetical protein  36.28 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3752  hypothetical protein  35.29 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0822  hypothetical protein  31.52 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3447  hypothetical protein  35.29 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3756  hypothetical protein  35.4 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3729  hypothetical protein  36.28 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3379  hypothetical protein  35.4 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3482  hypothetical protein  35.4 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2346  hypothetical protein  32.35 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1933  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3398  hypothetical protein  34.45 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3710  hypothetical protein  35.4 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70202e-17 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0345  hypothetical protein  34.43 
 
 		 417 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1984  hypothetical protein  28.97 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  32.79 
 
 		 456 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2017  hypothetical protein  28.97 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173704  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1069  hypothetical protein  41.27 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.239434  hitchhiker  0.0000020245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09520  hypothetical protein  44.26 
 
 		 377 aa  41.2  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  0.393278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>