64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0127 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0127  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  100 
 
 		 168 aa  320  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.864273  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4494  hypothetical protein  42.48 
 
 		 204 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0312898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3681  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)-like protein  43.36 
 
 		 247 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1699  putative NADH dehydrogenase chain J  36 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0312409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0711  hypothetical protein  32.64 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111012  decreased coverage  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2995  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  30.64 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0769  hypothetical protein  30.5 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1625  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  30.12 
 
 		 217 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0575261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4491  hypothetical protein  33.1 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0970  NADH dehydrogenase subunit J  29.41 
 
 		 240 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4986  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  28.74 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.489443  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0850  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  25 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.584399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5415  NADH dehydrogenase subunit J  23.21 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5385  NADH dehydrogenase subunit J  23.39 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.82495e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5470  NADH dehydrogenase subunit J  22.62 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5419  NADH dehydrogenase subunit J  22.62 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5144  NADH dehydrogenase subunit J  23.39 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4976  NADH dehydrogenase subunit J  23.39 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5536  NADH dehydrogenase subunit J  23.39 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4994  NADH dehydrogenase subunit J  23.39 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5535  NADH dehydrogenase subunit J  22.62 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0371244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5092  NADH dehydrogenase subunit J  23.6 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3215  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  27.7 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2547  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  41.38 
 
 		 335 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3745  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.82 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.881448  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1724  NADH dehydrogenase subunit J  27.47 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2248  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  30 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2621  NADH-quinone oxidoreductase, J subunit  30 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1187  NADH dehydrogenase subunit J  25.75 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.240778  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2525  NADH dehydrogenase subunit J  25.75 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2094  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.21 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0936  NADH dehydrogenase subunit J  28.24 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1995  NADH dehydrogenase subunit J  25.15 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0962272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2410  NADH dehydrogenase subunit J  29.41 
 
 		 199 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1307  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  29.79 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1245  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  27.45 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1372  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  27.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1271  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  27.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1525  NADH dehydrogenase subunit J  23.44 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2577  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  26.9 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.832542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3295  NADH dehydrogenase subunit J  22.93 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3813  NADH dehydrogenase subunit J  21.47 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3406  NADH dehydrogenase subunit J  31.75 
 
 		 96 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00773178  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5949  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  28.3 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1151  NADH dehydrogenase I chain J  27.01 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01871  NADH dehydrogenase subunit J  25.95 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4549  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  30.63 
 
 		 273 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2389  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  23.6 
 
 		 202 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000823649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3407  NADH dehydrogenase subunit J  23.53 
 
 		 173 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4038  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  22.08 
 
 		 173 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1502  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  30.9 
 
 		 219 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00317987  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0756  NADH dehydrogenase subunit J  23.78 
 
 		 200 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3337  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  28.32 
 
 		 253 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.30881  normal  0.29012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1040  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  27.15 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2804  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  30.39 
 
 		 223 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606138  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0983  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  27.86 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01781  NADH dehydrogenase subunit J  26.67 
 
 		 199 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0899  NADH dehydrogenase subunit J  27.12 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0160  NADH dehydrogenase subunit J  27.33 
 
 		 199 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0282  NADH dehydrogenase subunit J  28.95 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1272  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  28.8 
 
 		 222 aa  41.2  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1510  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  28.48 
 
 		 216 aa  40.8  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00574767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5171  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.07 
 
 		 222 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2052  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  25.3 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.432383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>