15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3712 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3712    100 
 
 		 923 bp  1830    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  87.54 
 
 		 1347 bp  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  86.64 
 
 		 942 bp  615  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4099    86 
 
 		 891 bp  557  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  83.98 
 
 		 1347 bp  476  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  83.95 
 
 		 507 bp  327  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3775  hypothetical protein  89.95 
 
 		 213 bp  224  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.787753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  89.1 
 
 		 864 bp  220  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0295    86.61 
 
 		 309 bp  206  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  87.44 
 
 		 501 bp  188  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4100    87.12 
 
 		 327 bp  149  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3774  hypothetical protein  91.18 
 
 		 297 bp  131  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6011  putative transposase protein  91.57 
 
 		 201 bp  109  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2609    91.18 
 
 		 255 bp  87.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  96.43 
 
 		 5499 bp  48.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>