17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4099 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  88.95 
 
 
1347 bp  942    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  90.79 
 
 
942 bp  1047    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  89.32 
 
 
1347 bp  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  94.04 
 
 
507 bp  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4099    100 
 
 
891 bp  1766    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  92.8 
 
 
864 bp  569  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3712    86 
 
 
923 bp  557  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674697  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3775  hypothetical protein  92.82 
 
 
213 bp  295  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.787753  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0295    91.09 
 
 
309 bp  258  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3774  hypothetical protein  96.08 
 
 
297 bp  170  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6011  putative transposase protein  89.77 
 
 
201 bp  103  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  86.36 
 
 
1323 bp  60  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  86.36 
 
 
1323 bp  60  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  86.36 
 
 
1323 bp  60  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  86.36 
 
 
1323 bp  60  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  86.36 
 
 
1323 bp  60  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  86.36 
 
 
1323 bp  60  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>