11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4100 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4100    100 
 
 		 327 bp  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  92.98 
 
 		 1347 bp  426  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  91.48 
 
 		 1347 bp  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  92.31 
 
 		 864 bp  410  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  89.59 
 
 		 501 bp  367  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2609    88.99 
 
 		 255 bp  252  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759909 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3712    87.12 
 
 		 923 bp  149  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  94.12 
 
 		 837 bp  52  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  94.12 
 
 		 837 bp  52  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  94.12 
 
 		 837 bp  52  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  96.43 
 
 		 837 bp  48.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>