36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2187 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  316  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  316  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  92.95 
 
 		 156 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  57.14 
 
 		 155 aa  167  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  57.14 
 
 		 155 aa  167  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  56.43 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  51.59 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  50.31 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  53.62 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  53.9 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  51.05 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  50.62 
 
 		 170 aa  157  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  51.8 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  51.77 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  47.74 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  52.9 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  50.69 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  50.36 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  50.36 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  49.64 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  47.14 
 
 		 169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  47.1 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  41.01 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  41.73 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  44.29 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  45.16 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  42.14 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  39.29 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  38.13 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  38.57 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  39.01 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  37.58 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  35.21 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  37.5 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  32.62 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>