36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4457 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  320  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  77.12 
 
 		 154 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  74.03 
 
 		 155 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  79.31 
 
 		 154 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  71.71 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  72.26 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  72.37 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  73.43 
 
 		 152 aa  233  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  73.08 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  71.13 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  71.13 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  68.21 
 
 		 165 aa  222  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  66.45 
 
 		 170 aa  221  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  64.56 
 
 		 159 aa  215  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  58.04 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  57.69 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  56.25 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  57.66 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  50.68 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  51.05 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  51.05 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  50.35 
 
 		 156 aa  156  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  46.1 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  44.44 
 
 		 158 aa  147  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  44.29 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  45.32 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  40.4 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  44.37 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  41.18 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  40.52 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  41.33 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  43.07 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  41.5 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  43.8 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  41.61 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  26.71 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>