36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3935 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  321  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  72.78 
 
 
158 aa  243  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  60.76 
 
 
158 aa  207  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  64.08 
 
 
157 aa  200  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  59.72 
 
 
159 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  58.33 
 
 
156 aa  187  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  57.64 
 
 
156 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  54.86 
 
 
156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  44.44 
 
 
155 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  44.93 
 
 
153 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  45.64 
 
 
154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  45.32 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  42.55 
 
 
160 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  42.67 
 
 
154 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  41.43 
 
 
169 aa  130  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  42.86 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  44.2 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  43.88 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  40.38 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  39.74 
 
 
155 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  39.74 
 
 
155 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  40.79 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  40.85 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  42.03 
 
 
155 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  41.73 
 
 
156 aa  123  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  41.43 
 
 
160 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  39.58 
 
 
147 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  38.16 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  35.33 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  42.64 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  44.93 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  36.88 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  35.92 
 
 
156 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  35.21 
 
 
156 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  35.21 
 
 
156 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>