36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1079 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  317  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  92.72 
 
 		 154 aa  293  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  89.03 
 
 		 154 aa  286  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  74.03 
 
 		 155 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  69.59 
 
 		 152 aa  228  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  73.72 
 
 		 156 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  64.74 
 
 		 159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  67.86 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  65.36 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  65.36 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  70.67 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  65.36 
 
 		 155 aa  216  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  63.35 
 
 		 165 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  60.13 
 
 		 170 aa  207  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  53.74 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  56.25 
 
 		 158 aa  184  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  56.2 
 
 		 160 aa  176  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  53.47 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  46.79 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  49.64 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  49.64 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  45.03 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  42 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  48.92 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  45.32 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  42.86 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  42.21 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  46.76 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  41.73 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  40.14 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  40 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  36.69 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  42.25 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  40.88 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  29.1 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>