36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3540 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  100 
 
 		 158 aa  317  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  84.91 
 
 		 160 aa  265  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  62.18 
 
 		 157 aa  206  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  62.16 
 
 		 165 aa  201  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  57.05 
 
 		 159 aa  201  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  55.69 
 
 		 170 aa  191  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  60.39 
 
 		 155 aa  190  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  60.39 
 
 		 155 aa  190  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  56.96 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  57.69 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  55.13 
 
 		 154 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  62.68 
 
 		 153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  54.78 
 
 		 155 aa  186  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  56.25 
 
 		 155 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  57.64 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  52.53 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  52.78 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  52.87 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  50.96 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  51.59 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  51.59 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  47.97 
 
 		 169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  41.38 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  40.56 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  36.71 
 
 		 158 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  38.85 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  40.85 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  45.27 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  47.14 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  36.71 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  40.43 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  38.06 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  38.06 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  36.36 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  34.51 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  32.67 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>