22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0726 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0726  phage integrase family protein  100 
 
 		 497 aa  1040    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2915  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 492 aa  153  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0811  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0758638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2980  integrase family protein  32.14 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2724  integrase family protein  32.14 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1705  phage integrase  26.85 
 
 		 496 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0212  integrase family protein  29.32 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4029  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.462542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0209  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3806  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3887  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0184  phage integrase family site specific recombinase  25.5 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.751019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3495  phage integrase family protein  26.39 
 
 		 485 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0036  hypothetical protein  26.63 
 
 		 462 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.693269 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4379  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0629  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  29.36 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  30.17 
 
 		 364 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 301 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  21.89 
 
 		 305 aa  47  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  27.1 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  23.89 
 
 		 319 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>