20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2980 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0212  integrase family protein  70.9 
 
 		 460 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2980  integrase family protein  100 
 
 		 466 aa  961    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2724  integrase family protein  100 
 
 		 466 aa  961    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1705  phage integrase  40.55 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2915  phage integrase family protein  37.05 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0209  phage integrase family protein  34.7 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157685  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4029  phage integrase family protein  34.7 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.462542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3495  phage integrase family protein  31.3 
 
 		 485 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0184  phage integrase family site specific recombinase  32.06 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.751019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0036  hypothetical protein  32.52 
 
 		 462 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.693269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3887  phage integrase family protein  30.7 
 
 		 433 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3806  phage integrase family protein  31.18 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0811  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0758638  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4379  phage integrase family protein  31.36 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0629  phage integrase family protein  31.36 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0726  phage integrase family protein  32.14 
 
 		 497 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  22.49 
 
 		 337 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  25.49 
 
 		 313 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 318 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 318 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>