More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3911 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3911  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
393 aa  779    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3206  acetyl-CoA acetyltransferase  88.72 
 
 
393 aa  671    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  65.9 
 
 
393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.533639  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0522  acetyl-CoA acetyltransferase  61.83 
 
 
395 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.061167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  55.67 
 
 
399 aa  442  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.76 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  52.82 
 
 
392 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  54.62 
 
 
395 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  53.59 
 
 
392 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  52.58 
 
 
394 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  52.05 
 
 
392 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
393 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  52.56 
 
 
392 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
392 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  53.08 
 
 
392 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  52.56 
 
 
392 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0363  acetyl-CoA acetyltransferase  53.35 
 
 
394 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  52.56 
 
 
393 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  52.31 
 
 
393 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  52.82 
 
 
392 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
393 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
393 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
393 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  52.31 
 
 
392 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
393 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  54.1 
 
 
395 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
392 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
392 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  51.93 
 
 
393 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 
393 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
393 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  51.93 
 
 
393 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
394 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 
401 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  48.58 
 
 
392 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
392 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
401 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 
392 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
393 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0846  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.874703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  51.02 
 
 
394 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3166  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
393 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.989786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  50.64 
 
 
393 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2991  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
393 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00959201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 
393 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5475  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
393 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5028  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
393 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  50.26 
 
 
394 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3016  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
393 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
393 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5467  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
427 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00479259  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5142  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 
393 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
393 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
393 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5193  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 
393 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5044  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 
393 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  47.8 
 
 
393 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5589  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 
393 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2365  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.44 
 
 
393 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
393 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 
391 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  51.93 
 
 
393 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5437  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
427 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000615424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5522  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
427 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5485  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
427 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000736039  hitchhiker  2.33e-22 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  47.8 
 
 
393 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3251  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4561  thiolase  52.7 
 
 
393 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
393 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
392 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3237  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000800068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 
392 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
393 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.09 
 
 
396 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
393 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>