112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2916 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2916  deoxynucleoside kinase  100 
 
 
213 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2779  deoxynucleoside kinase  80.28 
 
 
214 aa  347  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2629  putative deoxyguanosine kinase (DGUO kinase) (DGK) protein  59.81 
 
 
214 aa  246  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.045228  normal  0.657946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2864  putative deoxyguanosine kinase (dGuo kinase) (DGK) protein  57.42 
 
 
214 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180711  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2458  deoxynucleoside kinase  56.94 
 
 
214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3957  putative deoxynucleoside kinase  46.77 
 
 
226 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.691202  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2493  deoxynucleoside kinase  45.27 
 
 
231 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0742  putative deoxynucleoside kinase  45.77 
 
 
226 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.295919  normal  0.295396 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2052  deoxynucleoside kinase  46.38 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.945142  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2765  deoxynucleoside kinase  47.14 
 
 
212 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2629  deoxynucleoside kinase  45.59 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0880  deoxynucleoside kinase  43.06 
 
 
213 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3273  deoxynucleoside kinase family protein  45.32 
 
 
229 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.955449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3306  deoxynucleoside kinase family protein  45.32 
 
 
229 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0272  deoxynucleoside kinase  43.63 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0756  deoxynucleoside kinase  43.63 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0725  deoxynucleoside kinase  43.63 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3316  deoxynucleoside kinase family protein  45.32 
 
 
241 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3843  deoxynucleoside kinase  43.63 
 
 
228 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2322  deoxynucleoside kinase family protein  44.83 
 
 
227 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0505  deoxynucleoside kinase family protein  44.83 
 
 
229 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1094  deoxynucleoside kinase family protein  44.83 
 
 
229 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2201  deoxynucleoside kinase family protein  44.83 
 
 
229 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0675  deoxynucleoside kinase  42.65 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0650  deoxynucleoside kinase  42.79 
 
 
228 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0880  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.58 
 
 
216 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0598  deoxynucleoside kinase  40.19 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2044  deoxynucleoside kinase  39.42 
 
 
216 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1312  deoxynucleoside kinase family protein  45.32 
 
 
241 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3810  deoxynucleoside kinase  42.64 
 
 
215 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0180501 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3378  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.76 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0070721  normal  0.306738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3017  deoxynucleoside kinase  40.98 
 
 
246 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.464771  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2005  deoxynucleoside kinase  36.22 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3741  deoxynucleoside kinase  38.58 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.725001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3824  deoxynucleoside kinase  38.58 
 
 
215 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3683  deoxynucleoside kinase  38.07 
 
 
215 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.501998  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0102  deoxynucleoside kinase  39.33 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4748  deoxynucleoside kinase  32.04 
 
 
221 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2453  deoxynucleoside kinase  34.18 
 
 
205 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5843  deoxynucleoside kinase  32.66 
 
 
207 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.846725 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0203  deoxynucleoside kinase family protein  28.92 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.25755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1482  deoxynucleoside kinase  29.15 
 
 
204 aa  94.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1530  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  26.29 
 
 
375 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2583  deoxynucleoside kinase  33.88 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1719  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.06 
 
 
377 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0580  deoxynucleoside kinase  27.72 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0594  deoxynucleoside kinase  27.72 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0015  deoxynucleoside kinase  27.67 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0020  deoxynucleoside kinase family protein  27.72 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5298  deoxynucleoside kinase family protein  27.72 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000492782  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1279  deoxynucleoside kinase  27.88 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2346  deoxynucleoside kinase  29.56 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0477  deoxynucleoside kinase  27.78 
 
 
204 aa  85.5  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225024  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1826  deoxynucleoside kinase family protein  27.4 
 
 
213 aa  85.1  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0016  deoxynucleoside kinase family protein  27.23 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00113312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0016  deoxyguanosine kinase  27.23 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0127114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1672  deoxynucleoside kinase  28.64 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0015  deoxynucleoside kinase  27.72 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0942385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0022  deoxynucleoside kinase family protein  27.23 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000380267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0018  deoxynucleoside kinase family protein  27.23 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04865  deoxynucleoside kinase  26.56 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.336453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0016  deoxyguanosine kinase  27.23 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0015  deoxynucleoside kinase family protein  27.23 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000240044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0020  deoxynucleoside kinase family protein  27.23 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1862  deoxynucleoside kinase  25.37 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000853081 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0293  deoxynucleoside kinase  25.96 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6885  deoxynucleoside kinase  26.83 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.526713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0101  deoxynucleoside kinase  30.35 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0016  deoxynucleoside kinase  26.11 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259571  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05950  deoxyguanosine kinase/deoxyadenosine kinase subunit  26.4 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1627  deoxynucleoside kinase  26.96 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2581  deoxynucleoside kinase  25.51 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406863  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1448  deoxynucleoside kinase  33.52 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1772  deoxyguanosine kinase/deoxyadenosine kinase, putative  33.52 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1863  deoxynucleoside kinase  24.88 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000941818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2584  deoxynucleoside kinase  32.51 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl547  deoxynucleoside kinase  26.29 
 
 
206 aa  72  0.000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0597341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1498  deoxyadenosine kinase  23.44 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000536508  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5299  deoxynucleoside kinase  25.37 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0730  deoxynucleoside kinase  22.84 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2454  deoxynucleoside kinase  28.23 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0437  deoxynucleoside kinase  25.48 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4894  deoxynucleoside kinase  25.84 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0853567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1115  deoxynucleoside kinase  24 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0599  nucleoside kinase  23.68 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1288  deoxyadenosine kinase  25 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000237485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0579  deoxynucleoside kinase  22.95 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0593  deoxynucleoside kinase  22.95 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0067  deoxyguanosine kinase/deoxyadenosine kinase  27.47 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0515  deoxynucleoside kinase  25.87 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0849  deoxynucleoside kinase  21.5 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0202  deoxynucleoside kinase family protein  24.21 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0070  deoxynucleoside kinase family protein  26.92 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0015  deoxynucleoside kinase  21.32 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0617  deoxynucleoside kinase  23.08 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0014  deoxynucleoside kinase  21 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000448441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0778  deoxynucleoside kinase  27.31 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.330344  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2329  deoxyadenosine kinase  25.63 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0244  deoxyguanosine/deoxyadenosine kinase  27.43 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0030  deoxynucleoside kinase  26.18 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>