117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0650 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0650  deoxynucleoside kinase  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0675  deoxynucleoside kinase  99.12 
 
 
228 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3843  deoxynucleoside kinase  93.86 
 
 
228 aa  440  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0272  deoxynucleoside kinase  93.86 
 
 
228 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0756  deoxynucleoside kinase  93.86 
 
 
228 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0725  deoxynucleoside kinase  93.86 
 
 
228 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2629  deoxynucleoside kinase  92.54 
 
 
228 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3316  deoxynucleoside kinase family protein  81.14 
 
 
241 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3273  deoxynucleoside kinase family protein  81.14 
 
 
229 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.955449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3306  deoxynucleoside kinase family protein  81.14 
 
 
229 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2322  deoxynucleoside kinase family protein  80.7 
 
 
227 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0505  deoxynucleoside kinase family protein  80.7 
 
 
229 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1094  deoxynucleoside kinase family protein  80.7 
 
 
229 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2201  deoxynucleoside kinase family protein  80.7 
 
 
229 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0742  putative deoxynucleoside kinase  77.43 
 
 
226 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.295919  normal  0.295396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3957  putative deoxynucleoside kinase  75.66 
 
 
226 aa  349  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.691202  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1312  deoxynucleoside kinase family protein  79.82 
 
 
241 aa  346  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2493  deoxynucleoside kinase  74.32 
 
 
231 aa  340  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0880  deoxynucleoside kinase  47.32 
 
 
213 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2052  deoxynucleoside kinase  46.89 
 
 
213 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.945142  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2765  deoxynucleoside kinase  46.57 
 
 
212 aa  181  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2779  deoxynucleoside kinase  47.52 
 
 
214 aa  174  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2005  deoxynucleoside kinase  48.72 
 
 
227 aa  174  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0598  deoxynucleoside kinase  44.33 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2916  deoxynucleoside kinase  42.79 
 
 
213 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3017  deoxynucleoside kinase  42.06 
 
 
246 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.464771  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0880  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.63 
 
 
216 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3378  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.95 
 
 
230 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0070721  normal  0.306738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3810  deoxynucleoside kinase  43.41 
 
 
215 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0180501 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2629  putative deoxyguanosine kinase (DGUO kinase) (DGK) protein  44.5 
 
 
214 aa  158  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.045228  normal  0.657946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2458  deoxynucleoside kinase  43.06 
 
 
214 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2864  putative deoxyguanosine kinase (dGuo kinase) (DGK) protein  42.58 
 
 
214 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180711  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3741  deoxynucleoside kinase  44.39 
 
 
215 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.725001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3824  deoxynucleoside kinase  44.39 
 
 
215 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3683  deoxynucleoside kinase  43.9 
 
 
215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.501998  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2044  deoxynucleoside kinase  40.89 
 
 
216 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2453  deoxynucleoside kinase  43.94 
 
 
205 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4748  deoxynucleoside kinase  39.02 
 
 
221 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0102  deoxynucleoside kinase  43.78 
 
 
205 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2583  deoxynucleoside kinase  39.9 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1719  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
377 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0016  deoxynucleoside kinase  33.95 
 
 
212 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5843  deoxynucleoside kinase  38.04 
 
 
207 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.846725 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1530  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  38.04 
 
 
375 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04865  deoxynucleoside kinase  38.27 
 
 
383 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.336453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0016  deoxynucleoside kinase family protein  32.5 
 
 
211 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00113312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0016  deoxyguanosine kinase  32.5 
 
 
211 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0127114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0022  deoxynucleoside kinase family protein  32.5 
 
 
211 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000380267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0018  deoxynucleoside kinase family protein  32.5 
 
 
211 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0016  deoxyguanosine kinase  32.5 
 
 
211 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0015  deoxynucleoside kinase family protein  32.5 
 
 
211 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000240044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0015  deoxynucleoside kinase  33 
 
 
211 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0942385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5298  deoxynucleoside kinase family protein  32.5 
 
 
211 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000492782  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0020  deoxynucleoside kinase family protein  32.5 
 
 
211 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0020  deoxynucleoside kinase family protein  32 
 
 
211 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4894  deoxynucleoside kinase  31.43 
 
 
226 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0853567  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0101  deoxynucleoside kinase  34.83 
 
 
207 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0580  deoxynucleoside kinase  34.88 
 
 
220 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0594  deoxynucleoside kinase  34.88 
 
 
220 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0015  deoxynucleoside kinase  31.37 
 
 
211 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125792  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2584  deoxynucleoside kinase  31.82 
 
 
206 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2581  deoxynucleoside kinase  34.33 
 
 
204 aa  99.4  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406863  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2454  deoxynucleoside kinase  31.1 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0579  deoxynucleoside kinase  25.37 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0593  deoxynucleoside kinase  25.37 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0014  deoxynucleoside kinase  26.76 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000448441  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0203  deoxynucleoside kinase family protein  35.67 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.25755  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05950  deoxyguanosine kinase/deoxyadenosine kinase subunit  30 
 
 
204 aa  95.1  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1627  deoxynucleoside kinase  31.03 
 
 
204 aa  93.2  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1448  deoxynucleoside kinase  33.51 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1772  deoxyguanosine kinase/deoxyadenosine kinase, putative  33.51 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0202  deoxynucleoside kinase family protein  24.88 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1482  deoxynucleoside kinase  30.46 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1672  deoxynucleoside kinase  30.99 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0477  deoxynucleoside kinase  28.87 
 
 
204 aa  92.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225024  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0067  deoxyguanosine kinase/deoxyadenosine kinase  31 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0070  deoxynucleoside kinase family protein  31 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0014  deoxynucleoside kinase  25.35 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0444626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0015  deoxynucleoside kinase family protein  25.35 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000112881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0017  deoxynucleoside kinase family protein  25.35 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0015  deoxynucleoside kinase  25.35 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0014  deoxynucleoside kinase family protein  25.35 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000505458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0021  deoxynucleoside kinase family protein  25.35 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000324639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0019  deoxynucleoside kinase family protein  25.35 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000218647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5299  deoxynucleoside kinase family protein  25.35 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000261774  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0019  deoxynucleoside kinase family protein  25.35 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0015  deoxynucleoside kinase  27.46 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0015  deoxynucleoside kinase  25.35 
 
 
222 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000891347  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0730  deoxynucleoside kinase  25.87 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0778  deoxynucleoside kinase  30.41 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.330344  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1115  deoxynucleoside kinase  27.27 
 
 
226 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2346  deoxynucleoside kinase  31.19 
 
 
217 aa  88.2  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0030  deoxynucleoside kinase  31.02 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6885  deoxynucleoside kinase  30.69 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.526713 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0293  deoxynucleoside kinase  27.32 
 
 
215 aa  82  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5299  deoxynucleoside kinase  28.57 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1826  deoxynucleoside kinase family protein  27.54 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1279  deoxynucleoside kinase  28.44 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl547  deoxynucleoside kinase  26.96 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0597341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1862  deoxynucleoside kinase  27.66 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000853081 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>