17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0401 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0401  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 267 aa  534  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0433  putative transmembrane anti-sigma factor  81.65 
 
 		 267 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2886  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  41.83 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4456  putative transmembrane anti-sigma factor  40.23 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2272  putative transmembrane anti-sigma factor  32.84 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3116  putative transmembrane anti-sigma factor  32.53 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5730  putative transmembrane anti-sigma factor  27.27 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.381936 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6483  putative transmembrane anti-sigma factor  28.03 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  23.21 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  24.03 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  23 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  24.63 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  23.16 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  24.81 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  22.79 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  38.6 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  28.24 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>