13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2886 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2886  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0401  putative transmembrane anti-sigma factor  43.65 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4456  putative transmembrane anti-sigma factor  47.18 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0433  putative transmembrane anti-sigma factor  39.62 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2272  putative transmembrane anti-sigma factor  34.85 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3116  putative transmembrane anti-sigma factor  31.1 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5730  putative transmembrane anti-sigma factor  24.1 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.381936 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6483  putative transmembrane anti-sigma factor  23.93 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  24.22 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  24.5 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  25.86 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  22.57 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  25.21 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>