21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6027 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6027  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3578  hypothetical protein  35.16 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2862  hypothetical protein  35.42 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180678  normal  0.953602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2019  hypothetical protein  35.4 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5309  hypothetical protein  27.56 
 
 		 486 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00173209  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6015  hypothetical protein  31.34 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69620  hypothetical protein  29.45 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3829  hypothetical protein  29.81 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2094  hypothetical protein  32.56 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.390033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2070  hypothetical protein  32.56 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3749  hypothetical protein  29.35 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1045  hypothetical protein  36.67 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47840  predicted protein  33.93 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0218995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5210  hypothetical protein  41.82 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.765726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0509  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4154  hypothetical protein  36.11 
 
 		 496 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.525176  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0148  hypothetical protein  35.8 
 
 		 525 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444838  normal  0.443885 
 
 
-
 
NC_003296  RS04797  hypothetical protein  40.35 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0269206 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30920  predicted protein  23.81 
 
 		 562 aa  42  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0721946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0421  hypothetical protein  30.09 
 
 		 462 aa  41.6  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3767  hypothetical protein  43.33 
 
 		 279 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>