25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0509 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0509  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1045  hypothetical protein  38.53 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0477  hypothetical protein  44.64 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0501  hypothetical protein  44.64 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3749  hypothetical protein  48.94 
 
 
223 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5210  hypothetical protein  47.27 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.765726  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2094  hypothetical protein  41.67 
 
 
274 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.390033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2070  hypothetical protein  41.67 
 
 
274 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6015  hypothetical protein  27.78 
 
 
238 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69620  hypothetical protein  30 
 
 
232 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596016  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3301  hypothetical protein  28.68 
 
 
274 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_003296  RS04797  hypothetical protein  39.19 
 
 
232 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0269206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4014  hypothetical protein  30.83 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  hitchhiker  0.00342338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3809  hypothetical protein  32.26 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.376862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3829  hypothetical protein  30.3 
 
 
302 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3811  hypothetical protein  48.57 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.379378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0421  hypothetical protein  34.78 
 
 
462 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4154  hypothetical protein  37.1 
 
 
496 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.525176  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2528  hypothetical protein  26.83 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2658  hypothetical protein  26.83 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1598  hypothetical protein  30 
 
 
266 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6027  hypothetical protein  44.68 
 
 
212 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419545  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2588  conserved hypothetical protein  50 
 
 
280 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.771938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3767  hypothetical protein  43.24 
 
 
279 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2862  hypothetical protein  29.73 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180678  normal  0.953602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>