21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4154 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4154  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1022    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.525176  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3829  hypothetical protein  48.1 
 
 
302 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2019  hypothetical protein  31.83 
 
 
475 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0141  hypothetical protein  32.92 
 
 
528 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0154  hypothetical protein  31.92 
 
 
529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0148  hypothetical protein  31.91 
 
 
525 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444838  normal  0.443885 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3332  hypothetical protein  32.37 
 
 
555 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5309  hypothetical protein  29.03 
 
 
486 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00173209  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2876  hypothetical protein  30.65 
 
 
534 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0231  hypothetical protein  30.65 
 
 
534 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0215  hypothetical protein  30.48 
 
 
538 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886026  normal  0.752932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3301  hypothetical protein  44.53 
 
 
274 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0421  hypothetical protein  40.16 
 
 
462 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0580  hypothetical protein  35.78 
 
 
222 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0723157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3578  hypothetical protein  39.47 
 
 
209 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3067  hypothetical protein  27.62 
 
 
302 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2862  hypothetical protein  29.49 
 
 
145 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180678  normal  0.953602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3294  hypothetical protein  26.39 
 
 
306 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0509  hypothetical protein  37.1 
 
 
155 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1564  hypothetical protein  26.43 
 
 
306 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6027  hypothetical protein  36.11 
 
 
212 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>