19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0421 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0421  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  959    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5309  hypothetical protein  25.95 
 
 
486 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00173209  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3829  hypothetical protein  41.41 
 
 
302 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4154  hypothetical protein  40.16 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.525176  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2019  hypothetical protein  29.87 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3301  hypothetical protein  35.34 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2876  hypothetical protein  33.77 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0231  hypothetical protein  33.77 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0215  hypothetical protein  34.62 
 
 
538 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886026  normal  0.752932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0141  hypothetical protein  34.62 
 
 
528 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3332  hypothetical protein  29.73 
 
 
555 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0154  hypothetical protein  34.62 
 
 
529 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0148  hypothetical protein  33.08 
 
 
525 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444838  normal  0.443885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2862  hypothetical protein  30.39 
 
 
145 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180678  normal  0.953602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2070  hypothetical protein  30 
 
 
274 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2094  hypothetical protein  30 
 
 
274 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.390033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0509  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3811  hypothetical protein  29.11 
 
 
187 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.379378 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47553  predicted protein  25 
 
 
537 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>