18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2862 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2862  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  302  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180678  normal  0.953602 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6027  hypothetical protein  35.42 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419545  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30920  predicted protein  30.83 
 
 		 562 aa  64.7  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0721946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3578  hypothetical protein  34.74 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58441  predicted protein  32.39 
 
 		 505 aa  59.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.809582  normal  0.0168465 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00050  expressed protein  36.36 
 
 		 666 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05240  expressed protein  36.36 
 
 		 682 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0421  hypothetical protein  30.39 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66635  predicted protein  30.89 
 
 		 693 aa  54.3  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.207972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3301  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3829  hypothetical protein  36.11 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4154  hypothetical protein  29.49 
 
 		 496 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.525176  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47840  predicted protein  30.39 
 
 		 328 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0218995  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04487  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 		 785 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000162154  normal  0.0401638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2019  hypothetical protein  30.93 
 
 		 475 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  normal  0.225432 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06409  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 		 477 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.629719  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5309  hypothetical protein  28.57 
 
 		 486 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00173209  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0509  hypothetical protein  29.73 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>