18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3578 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3578  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6027  hypothetical protein  35.68 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2862  hypothetical protein  34.74 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180678  normal  0.953602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5309  hypothetical protein  28.24 
 
 		 486 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00173209  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5210  hypothetical protein  31.69 
 
 		 153 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.765726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1100  hypothetical protein  23.16 
 
 		 377 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.303009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4154  hypothetical protein  39.47 
 
 		 496 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.525176  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3829  hypothetical protein  34.83 
 
 		 302 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2070  hypothetical protein  43.64 
 
 		 274 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2094  hypothetical protein  43.64 
 
 		 274 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.390033 
 
 
-
 
NC_003296  RS04797  hypothetical protein  37.88 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0269206 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47553  predicted protein  28.99 
 
 		 537 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69620  hypothetical protein  38.1 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596016  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2588  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.771938  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6015  hypothetical protein  43.48 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0421  hypothetical protein  27.52 
 
 		 462 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3749  hypothetical protein  47.5 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3301  hypothetical protein  31.86 
 
 		 274 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>