21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5309 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5309  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  1013    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00173209  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4154  hypothetical protein  28.54 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.525176  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3829  hypothetical protein  41.73 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0141  hypothetical protein  26.16 
 
 		 528 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3301  hypothetical protein  41.73 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0154  hypothetical protein  24.68 
 
 		 529 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3332  hypothetical protein  28.26 
 
 		 555 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2019  hypothetical protein  36.57 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0148  hypothetical protein  27.21 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444838  normal  0.443885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0421  hypothetical protein  29.89 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0231  hypothetical protein  28.08 
 
 		 534 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2876  hypothetical protein  28.08 
 
 		 534 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0215  hypothetical protein  28.02 
 
 		 538 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886026  normal  0.752932 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6027  hypothetical protein  27.56 
 
 		 212 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3578  hypothetical protein  28.24 
 
 		 209 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3176  hypothetical protein  31.53 
 
 		 235 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.298691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04797  hypothetical protein  29.7 
 
 		 232 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0269206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6015  hypothetical protein  34.67 
 
 		 238 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69620  hypothetical protein  35.48 
 
 		 232 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2070  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2094  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.390033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>