32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1971 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1971  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
285 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2705  phospholipid/glycerol acyltransferase  86.27 
 
 
286 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0152  phospholipid/glycerol acyltransferase  53.06 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0265532  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0688  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.64 
 
 
257 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.44 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0595  hypothetical protein  34.17 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1194  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.03 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0108631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1369  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.5 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1013  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.6 
 
 
257 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1111  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.32 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3631  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.22 
 
 
251 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0186268  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5030  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.55 
 
 
252 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107709  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3157  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.25 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3744  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
271 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3435  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.56 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.25815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2739  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.32 
 
 
261 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2308  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.38 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1599  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.67 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1490  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.78 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000499778 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1522  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.4 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2495  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.6 
 
 
203 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000218384  hitchhiker  0.00272864 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0780  acyltransferase family protein  30.29 
 
 
246 aa  53.1  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5347  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.21 
 
 
246 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3620  hypothetical protein  26 
 
 
206 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0098  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.26 
 
 
213 aa  49.7  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0626908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0384  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.04 
 
 
229 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.320615  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1193  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.37 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.573508  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2413  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.75 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3698  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.75 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.339919  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2597  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.07 
 
 
233 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100958  normal  0.0920195 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13770  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.72 
 
 
235 aa  42  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0506817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>