28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3435 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3435  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
271 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.25815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3744  phospholipid/glycerol acyltransferase  97.79 
 
 
271 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3631  phospholipid/glycerol acyltransferase  87.65 
 
 
251 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0186268  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3157  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.59 
 
 
265 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5030  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.46 
 
 
252 aa  323  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107709  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2739  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.95 
 
 
261 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2705  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
286 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1369  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.34 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0152  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.22 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0265532  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1971  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.56 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1194  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.03 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0108631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1013  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.38 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.24 
 
 
253 aa  85.5  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.63 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0595  hypothetical protein  24.46 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0688  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.1 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1111  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.27 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3698  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.05 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.339919  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2413  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.05 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1599  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.65 
 
 
216 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1658  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.32 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1193  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.75 
 
 
240 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.573508  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1490  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.94 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000499778 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10791  phospholipid and glycerol acyltransferase  27.61 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.835783  normal  0.469275 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2779  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.53 
 
 
256 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3620  hypothetical protein  23.21 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0556  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.03 
 
 
237 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3595  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5347  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.88 
 
 
246 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>