27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1188 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 253 aa  521  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1194  phospholipid/glycerol acyltransferase  68.92 
 
 		 257 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0108631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1013  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.07 
 
 		 257 aa  361  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0595  hypothetical protein  63.86 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.65 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1111  phospholipid/glycerol acyltransferase  60.47 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1369  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.05 
 
 		 255 aa  327  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2705  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.36 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0688  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.07 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2739  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.29 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1971  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.25 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0152  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.4 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0265532  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3631  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.18 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0186268  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3744  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.24 
 
 		 271 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3435  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.24 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.25815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3157  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.94 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5030  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.68 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3620  hypothetical protein  24.26 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1599  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.19 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1490  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.02 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2495  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.27 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000218384  hitchhiker  0.00272864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3974  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.25 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000150159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0363  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.49 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000581696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4060  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.92 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0384  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.75 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.320615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3116  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  30.48 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4396  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.73 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000345745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>