34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2705 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2705  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1971  phospholipid/glycerol acyltransferase  86.27 
 
 		 285 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0152  phospholipid/glycerol acyltransferase  54.66 
 
 		 268 aa  268  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0265532  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0688  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.62 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  37 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0595  hypothetical protein  35.86 
 
 		 256 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1194  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.64 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0108631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1013  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.9 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5030  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.45 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3631  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.67 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0186268  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1369  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.49 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3744  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.22 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1111  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.66 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3435  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.25815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3157  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.43 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.36 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2739  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.35 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2308  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.76 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1599  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.03 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1490  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.79 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499778 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1522  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.85 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3620  hypothetical protein  25.77 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2495  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.09 
 
 		 203 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000218384  hitchhiker  0.00272864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5347  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.16 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0384  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.86 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.320615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0713  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.39 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0780  acyltransferase family protein  31.17 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220724  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2413  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.38 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3698  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.38 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.339919  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2597  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.7 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100958  normal  0.0920195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1313  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.58 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0173307  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3412  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.15 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.399806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.3 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.440706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2706  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.2 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0764625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>