23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3620 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3620  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0595  hypothetical protein  27.81 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0688  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.38 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1111  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.99 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.85 
 
 
253 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1369  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.05 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1013  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.15 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1194  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.97 
 
 
257 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0108631  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.26 
 
 
253 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1599  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.74 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1658  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.17 
 
 
251 aa  52.4  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1971  phospholipid/glycerol acyltransferase  26 
 
 
285 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0152  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.19 
 
 
268 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0265532  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2739  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.4 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2705  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.77 
 
 
286 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11991  phospholipid and glycerol acyltransferase  25.71 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12151  phospholipid and glycerol acyltransferase  27.34 
 
 
204 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.271497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1119  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.25 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0526083  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12141  phospholipid and glycerol acyltransferase  26.62 
 
 
204 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.891103  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1415  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.73 
 
 
252 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3435  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.21 
 
 
271 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.25815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3744  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.21 
 
 
271 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2308  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.65 
 
 
218 aa  41.6  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>